Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中细菌基因表达遗传标记的存在

2022-01-24 00:33:32 来源:
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导言:在早期阶段,自然界就开始了在不改变病原体肝细胞DNA秘密组织顺序的假定下来使其DNA发挥并不相同的功能,而这就是通过给DNA蛋白质上移除化学标上来解决问题的。DNA底物是灵长类的关键并不一定基因机制,其中的5-甲基胞嘧啶(5mc)是最常见的DNA;也之一。6mdA是病原体上限性;也种系统的基本均是由糖类,以外在灵长类中的不足未知的上限性;也种系统。先年前有不少研究课题报道,6mdA也存有于灵长类中的,但并无结论支持。

近日,在《生物学成果》上的一项研究课题中的,瑞典林雪平大学的研究课题职员得出有结论,灵长类肝细胞中的存有病原体并不一定基因标上很不太可能被污染源了,并且从未足够的结论来证明灵长类中的存有这种;也。

N6-甲基腺嘌呤(6mdA)是病原体中的为广泛的DNA;也,但最近在灵长类DNA中的也得到了并不一定。然而,研究课题职员写到,即使对来自不尽相同灵长类肝细胞类型的DNA进行的6mdA定量和核素观测研究课题也不一致。

为了实质性详述6mdA在灵长类谱系性能指标中的的作用,研究课题职员能用了活体将进化幼稚T辅助(NTH)肝生殖细胞为TH肝细胞亚群的灵活性。但是,与先年前的研究课题相反,他们断定TH分化过程中的6mdA的核素从未以外局叠加,并且观察到分化的T肝细胞中的的6mdA低水平与并未底物的以外测序扩增DNA不尽相同,这得出有结论6mdA并并未以可检查的低水平存有进化T肝细胞中的。

他们还分析了从六个进化肝细胞系中的分离出有的DNA中的的6mdA,并鉴定出有两个较强略低于背景噪声低水平的6mdA低水平的肝细胞系。差一点的是,两种单独的293T肝细胞系培养器皿较强并不相同的6mdA低水平,这得出有结论研究课题职员观察到的6mdA回波并非肝细胞类型本身固有的。或许,当他们实质性看时,他们断定两条6mdA低水平升高的肝细胞系被支原体属污染源,支原体属一种常见的病原体肝细胞培养器皿中的富含6mdA的二氧化碳。当他们用支原体特异性低剂量Plasmocin处理肝细胞系时,6mdA回波降低为A有性对照。

“我们意识到通过这些新技术检查到的6mdA'回波'只是噪声。但是,由于一些复杂的新技术情况,几种原理中的的背景噪声不是随机的,而是相符回波。”管理人员译者Colm Nestor(科尔迈·内斯特)在一份单方面中的说道。

研究课题职员分析了以年前通过DNA免疫沉淀测序、质谱和单分子实时测序在灵长类肝细胞中的定位或检查6mdA的努力。人们断定每种原理都有局限性或弱点,使并不一定基因标上的假白血病断定百余人很高,却是得出有结论林雪平研究课题职员认为不存有这种现象的结论。

这组译者写到:“我们证明,RNA和病原体污染源、免疫一个大反应性和其他新技术上限的联结已导致6mdA在灵长类DNA中的的反复出有错识别。随着DNA和RNA;也家族的不断增长,以及以年前并未知;也的丰富性越来越稀有,即使适用多种有序原理,我们也特别强调了出有错断定的不太可能性。我们建议适用;也和并未;也的测序DNA标准化作为今后对珍稀DNA;也的研究课题的最低要求,以及在适用年前更以外面地验证免疫特异性。”

内斯特补充说道,研究课题职员在研究课题比较稀有的现象时需要比较故意,选择适用哪种原理,并考虑他们是否无论如何在衡量存有的事器皿。他说道:“现在我们可以毫无疑问地说道灵长类中的不存有6mdA。关于6mdA,如果研究课题职员停止研究课题其实不存有的东西,则可以耗用大量时间和借贷,并且防止了很多令人后悔的事情。”

原始出有处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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